高靈敏度:能夠檢測到低至納克級別的蛋白質(zhì),可清晰分辨出不同含量的蛋白質(zhì)條帶,對于微量蛋白樣品的分析尤為適用,為蛋白質(zhì)組學(xué)研究中對低豐度蛋白的檢測提供了有力工具。
寬動態(tài)范圍:可同時準確檢測出樣品中含量差異較大的多種蛋白質(zhì),從高豐度蛋白到低豐度蛋白均能呈現(xiàn)出良好的線性響應(yīng),適用于復(fù)雜蛋白質(zhì)混合物的分析,無需對樣品進行繁瑣的分級或預(yù)富集處理。
快速染色:相比一些傳統(tǒng)的總蛋白染色方法,如考馬斯亮藍染色需要數(shù)小時甚至過夜,DP117 - Li - cor Revert™試劑能夠在較短時間內(nèi)完成染色過程,通常在 [X] 分鐘內(nèi)即可觀察到清晰的蛋白條帶,大大提高了實驗效率。
穩(wěn)定性好:染色后的凝膠在較長時間內(nèi)熒光信號穩(wěn)定,不易發(fā)生褪色現(xiàn)象。這使得科研人員有充足的時間對染色結(jié)果進行觀察、拍照記錄以及后續(xù)的數(shù)據(jù)分析,確保實驗結(jié)果的可靠性和可重復(fù)性。
兼容性強:該試劑與常見的聚丙烯酰胺凝膠電泳系統(tǒng)(如 SDS - PAGE)兼容,無論是不同濃度的分離膠還是濃縮膠,都能取得理想的染色效果。同時,它也適用于多種蛋白質(zhì)樣品制備方法,包括不同來源的細胞裂解液、組織勻漿等。
操作簡便:整個染色流程簡單直接,無需復(fù)雜的儀器設(shè)備和專業(yè)的化學(xué)操作技能。只需按照標準的操作步驟進行染色、洗滌等處理,即可獲得高質(zhì)量的染色結(jié)果,降低了實驗操作的難度和出錯概率。
凝膠準備:完成蛋白質(zhì)樣品的聚丙烯酰胺凝膠電泳后,小心取出凝膠,放入合適的染色容器中。建議使用塑料或玻璃制的染色盒,避免使用金屬容器,以防金屬離子對染色反應(yīng)產(chǎn)生干擾。用去離子水或適當?shù)木彌_液輕輕漂洗凝膠 1 - 2 次,每次漂洗時間約為 [X] 分鐘,以去除凝膠表面殘留的電泳緩沖液和雜質(zhì),但注意不要過度漂洗導(dǎo)致蛋白質(zhì)條帶損失。
試劑準備:從冰箱中取出 DP117 - Li - cor Revert™總蛋白染色試劑,使其在室溫下平衡一段時間(約 [X] 分鐘),以避免因溫度差異導(dǎo)致試劑在使用過程中出現(xiàn)沉淀或其他不穩(wěn)定現(xiàn)象。在使用前,輕輕搖勻試劑瓶,確保試劑均勻混合。根據(jù)凝膠的大小和數(shù)量,按照每平方厘米凝膠面積使用 [X] mL 染色試劑的比例,準確量取所需的染色試劑體積,倒入干凈的容器中備用。
其他材料準備:準備適量的洗滌緩沖液,一般可使用含 0.1% Tween - 20 的 PBS 緩沖液(pH 7.4)。同時,準備好干凈的濾紙、鑷子等實驗工具,用于后續(xù)操作過程中的凝膠轉(zhuǎn)移和吸干多余液體。
染色反應(yīng):將準備好的染色試劑緩慢倒入裝有凝膠的染色容器中,確保凝膠浸沒在染色試劑中,且染色試劑均勻覆蓋凝膠表面。為了保證染色均勻性,可將染色容器置于水平搖床上,設(shè)置低速(約 [X] rpm)振蕩,在室溫下進行染色反應(yīng)。染色時間根據(jù)實驗需求和樣品情況而定,一般情況下,染色 [X] 分鐘即可觀察到初步的蛋白條帶,但對于一些復(fù)雜樣品或需要更高靈敏度的實驗,可適當延長染色時間至 [X] 分鐘。在染色過程中,可觀察到凝膠上的蛋白質(zhì)條帶逐漸顯現(xiàn)出熒光信號。
洗滌步驟:染色反應(yīng)結(jié)束后,小心倒去染色試劑。染色試劑可根據(jù)實驗室的環(huán)保規(guī)定進行妥善處理,切勿隨意丟棄。然后,向染色容器中加入適量的洗滌緩沖液,將凝膠浸泡在洗滌緩沖液中,在水平搖床上以中速(約 [X] rpm)振蕩洗滌 [X] 次,每次洗滌時間為 [X] 分鐘。洗滌的目的是去除凝膠表面未結(jié)合的染色試劑,降低背景熒光信號,提高蛋白條帶的清晰度和對比度。每次洗滌后,使用干凈的濾紙小心吸干凝膠表面多余的洗滌緩沖液,但注意不要刮傷凝膠。
熒光成像:洗滌完成后,將凝膠置于近紅外熒光成像系統(tǒng)中進行觀察和拍照。根據(jù)成像系統(tǒng)的操作說明,設(shè)置合適的激發(fā)波長和發(fā)射波長,對于 DP117 - Li - cor Revert™試劑,激發(fā)波長一般在 [具體激發(fā)波長范圍],發(fā)射波長在 [具體發(fā)射波長范圍]。調(diào)整成像系統(tǒng)的曝光時間、增益等參數(shù),以獲得清晰、對比度良好的蛋白條帶圖像。確保成像環(huán)境光線較暗,避免環(huán)境光對熒光信號產(chǎn)生干擾。
條帶分析:使用專業(yè)的凝膠分析軟件對拍攝的圖像進行分析。軟件可用于測量蛋白條帶的強度、分子量大小(通過與已知分子量的蛋白 Marker 條帶對比)以及計算不同條帶的相對含量等參數(shù)。在分析過程中,可根據(jù)實驗需求設(shè)置合適的閾值和背景扣除參數(shù),以提高分析結(jié)果的準確性。將分析結(jié)果與實驗預(yù)期進行對比,判斷蛋白質(zhì)樣品的組成和表達情況,為后續(xù)的科研工作提供數(shù)據(jù)支持。
試劑保存:DP117 - Li - cor Revert™總蛋白染色試劑應(yīng)避光保存于 4℃冰箱中。避免試劑受到光照、高溫或反復(fù)凍融,這些因素可能會導(dǎo)致試劑的活性降低,影響染色效果。在每次使用后,應(yīng)及時將試劑瓶蓋緊,放回冰箱保存。
安全防護:在使用試劑過程中,需佩戴手套、護目鏡等防護裝備,避免試劑與皮膚和眼睛直接接觸。若不慎接觸到試劑,應(yīng)立即用大量清水沖洗,并根據(jù)具體情況及時就醫(yī)。試劑具有一定的化學(xué)腐蝕性,操作時應(yīng)在通風良好的環(huán)境中進行,避免吸入試劑揮發(fā)的氣體。
實驗條件優(yōu)化:不同的實驗樣品和實驗?zāi)康目赡苄枰獙θ旧珬l件進行優(yōu)化。例如,對于某些特殊來源的蛋白質(zhì)樣品,可能需要調(diào)整染色時間、染色試劑濃度或洗滌次數(shù)等參數(shù),以獲得最佳的染色效果。在進行正式實驗前,建議進行預(yù)實驗,摸索出適合自己樣品的最佳實驗條件。
凝膠質(zhì)量:凝膠的制備質(zhì)量對染色結(jié)果有重要影響。確保在制備聚丙烯酰胺凝膠時,各試劑的比例準確、混合均勻,凝膠聚合充分且無氣泡。電泳過程中,要保證電壓、電流穩(wěn)定,避免蛋白質(zhì)條帶出現(xiàn)拖尾、變形等異常現(xiàn)象,以保證染色后的蛋白條帶能夠準確反映樣品中蛋白質(zhì)的真實情況。
儀器校準:在使用近紅外熒光成像系統(tǒng)前,需對儀器進行校準,確保儀器的波長準確性、熒光強度測量準確性等指標符合要求。定期對儀器進行維護和清潔,防止儀器內(nèi)部光學(xué)部件受到污染,影響成像質(zhì)量。同時,要注意儀器的軟件版本是否為最新,及時更新軟件以獲得更好的分析功能和數(shù)據(jù)處理能力。
染色條帶不清晰或無條帶:可能原因一是染色時間過短,可適當延長染色時間再次觀察;二是蛋白質(zhì)樣品上樣量過低,可增加上樣量并重做實驗;三是染色試劑失效,檢查試劑保存條件和有效期,若試劑已過期或保存不當,應(yīng)更換新的試劑。
背景熒光過高:可能是洗滌不充分,增加洗滌次數(shù)或延長洗滌時間;也可能是染色試劑濃度過高,可適當降低染色試劑濃度,重新進行染色實驗。另外,確保實驗過程中使用的容器和工具干凈無污染,避免引入雜質(zhì)導(dǎo)致背景升高。
條帶出現(xiàn)拖尾或變形:這可能是電泳過程中電壓不穩(wěn)定、凝膠制備不均勻或樣品存在雜質(zhì)等原因引起的。檢查電泳設(shè)備的電源穩(wěn)定性,優(yōu)化凝膠制備過程,確保凝膠均勻;對蛋白質(zhì)樣品進行進一步純化,去除雜質(zhì)后再進行電泳和染色實驗。