高容量 cDNA 逆轉錄試劑盒和普通逆轉錄試劑盒的核心操作步驟大致相似,都是從樣本準備、反應體系配制到進行逆轉錄反應,但在具體細節和側重點上存在明顯區別。
高容量 cDNA 逆轉錄試劑盒:由于其對 RNA 樣本的兼容性較好,能適應部分降解或純度不太高的樣本,在樣本準備時,對 RNA 提取后的純度要求相對寬松。不過,為保證獲得理想的高產量 cDNA,仍需盡量去除可能影響逆轉錄反應的雜質,如多糖、多酚等。在面對大量樣本時,樣本的批量處理能力較強,可高效完成多個樣本的準備工作,以滿足后續大規模實驗對 cDNA 產量的需求。
普通逆轉錄試劑盒:對 RNA 樣本質量要求較為苛刻,通常需要高質量、高純度且完整性好的 RNA。在 RNA 提取過程中,需更嚴格地按照操作規范進行,以確保提取的 RNA 純度達標(A260/A280 比值一般要求在 1.8 - 2.0 之間 )。若樣本存在降解或純度不佳,可能導致逆轉錄效率低下甚至失敗,所以往往需要對提取后的 RNA 進行更精細的質量檢測和純化處理,以保證逆轉錄反應順利進行。
高容量 cDNA 逆轉錄試劑盒:為實現高產量 cDNA 合成,反應體系的設計通常會考慮加大 RNA 模板的投入量以及各反應成分的比例。以 Thermo 的高容量 cDNA 逆轉錄試劑盒為例,在 20μl 反應體系中,可加入 2μg 總 RNA ,同時配套的緩沖液、dNTPs、逆轉錄酶等試劑的用量也經過優化,以支持大量 RNA 的逆轉錄。此外,一些高容量 cDNA 逆轉錄試劑盒會將部分試劑進行預混,如整合為 2x RT 緩沖液混合液和 20x 酶混合液(含逆轉錄酶和 RNase 抑制劑),減少移液步驟,方便實驗人員快速配制反應體系,尤其適用于處理大量樣本的情況。
普通逆轉錄試劑盒:反應體系相對靈活,根據不同的實驗需求和樣本情況,RNA 模板的用量范圍較廣,從幾十納克到幾微克不等。各試劑成分的比例也較為常規,在配制過程中,需要實驗人員根據說明書精確量取每種試劑,對操作的準確性要求較高。而且,普通逆轉錄試劑盒的試劑往往較為分散,不像高容量 cDNA 逆轉錄試劑盒有較多預混形式,因此在配制反應體系時,移液操作步驟相對較多,耗時也可能更長。
高容量 cDNA 逆轉錄試劑盒:標準反應時間一般較長,如 Thermo 的高容量 cDNA 逆轉錄試劑盒標準反應時間通常為 120 分鐘 。較長的反應時間是為了確保在加大 RNA 模板量的情況下,逆轉錄酶能夠充分發揮作用,實現高效且穩定的 cDNA 合成,從而獲得足夠量的 cDNA 產物。在反應過程中,對反應溫度和時間的控制要求嚴格,以保證逆轉錄反應的順利進行和產物質量。
普通逆轉錄試劑盒:反應時間相對靈活,部分產品可在較短時間內完成逆轉錄反應,如一些快速逆轉錄試劑盒可在 30 - 60 分鐘內完成。較短的反應時間適合對時間要求較高、樣本量較小的實驗,能夠快速獲得 cDNA 產物用于后續分析。不過,不同品牌和型號的普通逆轉錄試劑盒在反應時間上差異較大,實驗人員需要根據具體產品的說明書來確定最佳反應條件。